Shiitake gombavírus genetikai vizsgálata

A kép illusztráció.

Az 1970-es években azonosítottak olyan gombavírusokat, melyek a shiitake termesztésben megjelentek, de a jelenlétüket nem lehetett összekötni konkrét betegségek kialakulásával. A génszekvenciájuk egyelőre ismeretlen volt. A napokban jelent meg egy tanulmány, ami ezt a dupla szálú RNS (dsRNS) vírust azonosította kereskedelmi törzsekben és szekvenálását követően a genomja megismerésre került.

A vírus a kísérletben a L. Edodes gombavírus HKB (LeV) nevet kapta. Az RNS-irányított RNS-polimeráz (RdRp) szekvenálást követően filogenetikai elemzést végeztek a vírussal. A filogenetikai elemzés alapján a talált dsRNS vírust egy kládba sorolták a Phlebiopsis gigantea és a Helicobasidium mompa bazídiumos gombákban megtalálható mikovírusokkal. A klád kívül esik a Totiviridae és a Chrysoviridae családokon, a genomszekvencia és a vizsgálatok alapján egy lineáris fehérjeburok nélküli drRNS vírusról van szó.

A teljes tanulmány megtalálható és letölthető a folyóirat oldalán.

Forrás: Virology Journal